頼りなさすぎるヒーロー、アントマン（ポール・ラッド）と完璧すぎるヒロイン、ワスプ（エヴァンジェリン・リリー）。2人の前に、すべてをすり抜ける神出鬼没の謎の美女ゴースト（ハンナ・ジョン・カメン）が現れる。ゴーストが狙うのは、アントマン誕生の鍵を握る研究所。敵の手に渡れば、世界中であらゆるもののサイズが自在に操られてしまう。さらに、金目当ての武器ディーラーからの襲撃や、アントマンを監視するFBIの追跡も加わり、人や車、ビルなど全てのサイズが変幻自在に変わる“何でもアリ”の大騒動に！ユニークなパワーと微妙なチームワークで、アントマンとワスプは世界を脅かす“秘密”を守り切れるのか……？